Spring naar hoofdinhoud
Boekhouding & koppelingen

Het beste factuurprogramma in 2026: een eerlijke vergelijking

Er is geen beste factuurprogramma in het algemeen, wel een beste per situatie. Factureer je een paar keer per maand, dan is een gratis online tool genoeg. Wil je boekhouding en facturatie in een pakket, dan kom je uit bij e-Boekhouden, SnelStart, Yuki of Exact Online. Verkoop je via een webshop of marktplaats met tientallen orders, dan heb je iets nodig dat per bestelling automatisch factureert.

Er zijn tientallen programma's om een factuur te maken, van zware boekhoudpakketten tot losse apps, waardoor ondernemers door de bomen het bos niet meer zien. Een helder overzicht per type programma met een concrete keuzehulp, zodat je weet welk factuurprogramma past bij je onderneming, je volume en je budget.

Ik ben Mehmet Karabulut en ik heb zelf een factuurprogramma gebouwd: de motor achter Winkel Factuur. Dat maakt mij geen neutrale partij, en ik ga ook niet doen alsof. Wat het wel betekent, is dat ik de afgelopen jaren precies heb gezien waar ondernemers op vastlopen als ze de verkeerde soort software kiezen - en dat is vaker een kwestie van de verkeerde categorie dan van het verkeerde merk. Hieronder loop ik de Nederlandse opties langs, per type, met erbij wanneer je ze juist niet moet nemen. Ook die van mij.

Samenvatting

  • Programma's om facturen te maken vallen in drie groepen: boekhoudpakketten, losse facturatiesoftware en e-facturatie- of koppelplatforms.
  • Boekhoudpakketten zoals Yuki, SnelStart, e-Boekhouden en Exact Online combineren facturatie met je volledige administratie.
  • Voor wie alleen snel wil factureren is een losse facturatietool of online programma vaak eenvoudiger en goedkoper.
  • Webshop- en marktplaatsverkopers hebben automatisering nodig: een factuur per bestelling, niet handwerk.
  • Begin gerust gratis en stap over zodra je meer nodig hebt, zoals koppelingen, automatisering of e-facturatie via Peppol.
Bijgewerkt op
10 min leestijd
FacturatieSoftwareBoekhoudingToolsVergelijkingZZP
In Welk Programma Maak Je een Factuur? Complete Keuzehulp

Eerst dit: wanneer je Winkel Factuur niet moet nemen

Ik zet dit bewust bovenaan, want het scheelt je het lezen van de rest als je jezelf hierin herkent.

• Je wilt je hele boekhouding in een pakket. Wij factureren; wij doen geen bonnen, geen grootboek, geen jaarrekening. Wil je dat op een plek, neem dan e-Boekhouden, SnelStart, Yuki of Exact Online. Je koppelt onze facturen er wel aan, maar het pakket blijft je basis.

• Je stuurt een handvol facturen per maand aan vaste klanten. Dan heb je geen automatisering nodig die per bestelling werkt. Een gratis online tool of het factuurscherm van je boekhoudpakket doet het prima.

• Je werkt met een accountant die in Twinfield of Exact zit. Volg je accountant. Een koppeling is dan bijna altijd verstandiger dan een extra systeem ernaast.

Wat wel ons terrein is: je verkoopt via bol.com, Amazon, Shopify, WooCommerce, Etsy of een Mirakl-marktplaats, je krijgt tientallen tot honderden orders, en elke order moet een correcte factuur worden met het juiste BTW-tarief per land. Dat is een ander probleem dan "een factuur maken", en de meeste boekhoudpakketten lossen het niet op omdat ze niet uit je verkoopkanaal lezen.

De drie vragen die de keuze bepalen

Als iemand mij vraagt welk programma hij moet nemen, stel ik altijd dezelfde drie vragen terug. Ze filteren sneller dan welke featurelijst dan ook.

1. Hoeveel facturen per maand, en komen ze ergens vandaan? Tien facturen die je zelf intikt is een andere wereld dan tweehonderd orders die uit een verkoopkanaal komen. Bij de eerste kost automatisering je meer tijd dan ze oplevert; bij de tweede is handmatig werken binnen een maand onhoudbaar.

2. Verkoop je over de grens? Dit is het punt waar ik de meeste ellende zie. Zodra je aan consumenten in andere EU-landen levert, krijg je met de OSS-regeling te maken en moet je het BTW-tarief van het land van de klant rekenen. Software die alleen 21, 9 en 0 procent kent, laat je dan stilletjes verkeerde facturen sturen. Vraag hier expliciet naar.

3. Wie leest je facturen straks? Je accountant, de Belastingdienst, of een zakelijke klant die UBL via Peppol wil ontvangen? Die laatste groep groeit, en een tool die alleen PDF maakt loopt daar op vast. Kijk of het programma UBL kan exporteren voordat je het nodig hebt.

Pas als deze drie beantwoord zijn, is de vergelijking hieronder zinvol. Anders vergelijk je pakketten die niet eens in dezelfde categorie zitten.

In welk programma maak je een factuur?

Het antwoord op de vraag in welk programma je een factuur maakt, hangt af van wie je bent en wat je verkoopt. Een ZZP'er met een paar facturen per maand heeft heel andere wensen dan een webshop met honderden bestellingen of een bedrijf met een eigen boekhoudafdeling.

Grofweg zijn er drie soorten programma's waarmee je facturen maakt: volledige boekhoudpakketten (zoals Yuki, SnelStart, e-Boekhouden en Exact Online), losse facturatiesoftware en apps (van een Excel-sjabloon tot een online factuurtool), en e-facturatie- en koppelplatforms die facturen via Peppol versturen. Wil je eerst de basis van factureren onder de knie krijgen? Lees dan onze complete gids over factuur maken.

Direct aan de slag? Maak nu gratis je eerste factuur — geen creditcard nodig, geen BTW-nummer verplicht. Start gratis →

In de volgende secties bespreken we de programma's per categorie, met per programma een verwijzing naar de uitgebreide handleiding. Daarna geven we een concrete keuzehulp, zodat je precies weet welk programma bij jouw situatie past.

Maak je facturen automatisch, ook vanuit je webshop

Winkel Factuur maakt automatisch correcte facturen voor elke bestelling uit je webshop of marktplaats. 15 dagen gratis proberen, geen creditcard nodig.

Hoe kies je het juiste factuurprogramma?

Voordat je een programma kiest, is het slim om te bepalen wat je echt nodig hebt. Een te zwaar boekhoudpakket kost onnodig veel tijd en geld, terwijl een te simpele tool je laat vastlopen zodra je groeit. Let op de volgende punten:

• Type onderneming: Ben je ZZP'er, webshop, marktplaatsverkoper of een groter bedrijf? Hoe complexer je administratie, hoe eerder een volledig boekhoudpakket loont.

• Aantal facturen: Maak je een paar facturen per maand of honderden? Bij hoog volume wil je automatisering in plaats van handwerk.

• Koppelingen: Verkoop je via bol.com, Amazon, Shopify of WooCommerce? Dan wil je dat facturen automatisch uit je verkoopkanaal rollen.

• E-facturatie: Lever je aan de overheid of grote bedrijven, dan heb je gestructureerde e-facturen via Peppol (UBL) nodig. Hier komen we verderop op terug.

• Prijs: Van gratis tot tientallen euro's per maand. Reken niet alleen de abonnementsprijs mee, maar ook de tijd die je bespaart.

• Gemak: Hoe snel maak je een nette factuur zonder handleiding? Voor veel ondernemers is eenvoud belangrijker dan honderd functies.

Wil je programma's naast elkaar zien? Bekijk onze vergelijking van facturatiesoftware en de uitgebreide factuursoftware-vergelijking van 2026, met functies en prijzen op een rij.

Boekhoudpakketten met facturatie: Yuki, SnelStart, e-Boekhouden en Exact

Boekhoudpakketten doen meer dan factureren: ze houden je hele administratie bij, van bonnen tot btw-aangifte. Facturen maken is daarbij één onderdeel. Dit zijn de bekendste Nederlandse pakketten.

• Yuki: Een sterk geautomatiseerd boekhoudpakket dat veel administratie uit handen neemt, vaak in samenwerking met een boekhouder. Handig als je boekhouding en facturatie wilt combineren. Lees hoe je een factuur maakt in Yuki.

• SnelStart: Een populair pakket onder ZZP'ers en het MKB, met facturatie en boekhouding in één. Bekijk de stappen om een factuur te maken in SnelStart.

• e-Boekhouden: Een betaalbaar online boekhoudpakket dat veel startende ondernemers gebruiken. Zo maak je een factuur in e-Boekhouden.

• Exact Online: Een uitgebreid pakket voor groeiende bedrijven, met veel functies en koppelingen. Lees over de facturatiekoppeling met Exact Online.

Wanneer kies je een boekhoudpakket?
Een volledig pakket loont als je je boekhouding en facturatie op één plek wilt, samenwerkt met een boekhouder of een complexere administratie hebt. Wil je vooral snel facturen maken, dan is zo'n pakket vaak zwaarder (en duurder) dan nodig.

Zakelijke boekhoudsoftware: Twinfield en grotere pakketten

Naast de bekende MKB-pakketten zijn er zwaardere oplossingen voor accountantskantoren en grotere organisaties. Twinfield is daar een bekend voorbeeld van: een online boekhoudplatform dat veel door accountants en financiële afdelingen wordt gebruikt.

Dit soort software is krachtig, maar ook complexer en prijziger. Voor de meeste ZZP'ers en kleine webshops is het overkill. Werk je samen met een accountant die Twinfield gebruikt, dan is een koppeling vaak handiger dan het pakket zelf voor je facturatie gebruiken. Lees meer over de Twinfield-koppeling voor je boekhouding.

Wanneer past zwaardere boekhoudsoftware?
Als je een grotere organisatie hebt, met meerdere medewerkers, een eigen boekhoudafdeling of een accountant die in dit pakket werkt. Maak je vooral facturen en wil je geen complexe software, dan kijk je beter naar lichtere facturatietools.

Maak je facturen automatisch, ook vanuit je webshop

Winkel Factuur maakt automatisch correcte facturen voor elke bestelling uit je webshop of marktplaats. 15 dagen gratis proberen, geen creditcard nodig.

E-facturatie en Peppol: factureren volgens de nieuwe standaard

Steeds meer facturen worden niet als pdf, maar als gestructureerd databestand (UBL) verstuurd via het Peppol-netwerk. Voor leveringen aan de overheid is e-facturatie al verplicht, en door de Europese ViDA-plannen wordt het de komende jaren breder de norm.

Er zijn aparte tools die zich op e-facturatie en Peppol richten. Billit en Billtobox zijn voorbeelden van platforms die facturen digitaal verwerken en via Peppol kunnen versturen. Of je dit nodig hebt, hangt af van je klanten: lever je aan de overheid of grote bedrijven, dan is een Peppol-oplossing belangrijk.

Wil je precies weten hoe e-facturatie en Peppol in Nederland werken? Lees onze Peppol Nederland gids, met uitleg over UBL, de verplichtingen en hoe je aansluit.

Goed om te weten: veel moderne facturatietools ondersteunen UBL en Peppol standaard, zodat je geen apart platform nodig hebt. Controleer dus eerst of je huidige of gewenste tool dit al kan voordat je een aparte e-facturatieoplossing aanschaft.

Losse factuurprogramma's en apps: Excel, gratis tools, Kyte en Lucy

Niet iedereen wil een volledig boekhoudpakket. Voor veel ZZP'ers en kleine ondernemers is een lichtere oplossing genoeg om snel een nette factuur te maken.

• Excel of Word: De klassieke manier. Gratis en flexibel, maar foutgevoelig: je houdt zelf de nummering, btw-berekening en het archief bij. Bekijk hoe je een factuur maakt in Excel en waar je op moet letten.

• Gratis online factuurtools: Met een online tool maak je in een paar minuten een professionele factuur, zonder installatie. Lees onze gids over gratis online facturen maken.

• Factuur-apps: Apps zoals Kyte en Lucy richten zich op ondernemers die onderweg of vanaf hun telefoon willen factureren. Handig voor wie veel buiten de deur werkt.

Wanneer kies je een losse factuurtool?
Als je vooral snel en eenvoudig wilt factureren, weinig administratie hebt en geen volledig boekhoudpakket nodig hebt. Let er wel op dat je tool de btw correct berekent en je facturen veilig bewaart: de bewaarplicht is 7 jaar.

Gratis vs. betaald: welk factuurprogramma past bij je budget?

Een veelgestelde vraag: kan ik niet gewoon gratis factureren? Het korte antwoord is ja, maar er zijn verschillen tussen gratis en betaalde programma's.

Gratis programma's zijn ideaal om te starten. Je maakt er nette facturen mee zonder kosten. De beperkingen zitten vaak in het aantal facturen, het ontbreken van automatisering of koppelingen, en soms een logo van de aanbieder op je factuur. Vergelijk de opties in onze vergelijking van gratis factuurprogramma's voor ZZP'ers.

Betaalde programma's bieden meer: automatische facturen, koppelingen met je verkoopkanalen, betalingsherinneringen, btw-overzichten en een veilig archief. Voor wie veel factureert, verdient een betaald abonnement zich snel terug in bespaarde tijd.

Een tussenweg: sommige tools, zoals Winkel Factuur, combineren beide. Je probeert elk pakket 15 dagen gratis en betaalt daarna vanaf €9 per maand voor 100 facturen. Zo begin je zonder kosten en groeit het programma met je mee.

Maak je facturen automatisch, ook vanuit je webshop

Winkel Factuur maakt automatisch correcte facturen voor elke bestelling uit je webshop of marktplaats. 15 dagen gratis proberen, geen creditcard nodig.

Speciaal voor webshops en marktplaatsen: Winkel Factuur

Verkoop je via een webshop of marktplaats zoals bol.com, Amazon, Shopify of WooCommerce? Dan heb je een ander soort programma nodig dan een ZZP'er met een handvol facturen. Bij tientallen of honderden bestellingen is handmatig factureren geen optie.

Automatisch factureren per bestelling
Winkel Factuur maakt automatisch een correcte factuur bij elke order, met het juiste btw-tarief, en verstuurt die naar je klant. Je hoeft niets meer over te typen.

Alles op één plek
Al je facturen uit verschillende verkoopkanalen komen overzichtelijk samen, klaar voor je boekhouding of je accountant. Je kunt eenvoudig exporteren (bijvoorbeeld als UBL) naar je boekhoudpakket.

Eenvoud voorop
Geen zwaar boekhoudpakket dat je eerst moet leren. Winkel Factuur is gericht op snel en foutloos factureren, juist voor webshop- en marktplaatsverkopers die hun tijd liever aan verkopen besteden.

Direct beginnen
Je hebt geen btw-nummer nodig om te starten en je probeert elk pakket 15 dagen gratis. Groei je verder, dan schaal je mee: Basis €15 voor 400 facturen, Populair €22 voor 1.500.

Klaar om je facturatie te automatiseren?

Winkel Factuur maakt automatisch een correcte factuur voor elke bestelling uit je webshop of marktplaats, past de juiste btw toe en bewaart alles veilig. 15 dagen gratis proberen, daarna vanaf €9 per maand voor 100 facturen.

Start gratis →

Keuzehulp: in welk programma maak jij het beste je factuur?

Tot slot een concrete keuzehulp. Welk programma bij jou past, hangt vooral af van je type onderneming en je volume:

• Startende ZZP'er, paar facturen per maand: Begin met een gratis online factuurtool of een eenvoudig programma. Upgraden kan altijd nog.

• ZZP'er met groeiende administratie: Kies een betaalbaar boekhoudpakket (zoals e-Boekhouden of SnelStart) als je facturatie en boekhouding wilt combineren, of een lichte facturatietool als je vooral wilt factureren.

• Webshop- of marktplaatsverkoper: Kies een tool die automatisch factureert per bestelling en koppelt met je verkoopkanalen, zoals Winkel Factuur.

• Groter bedrijf of samenwerking met een accountant: Kijk naar Exact Online of Twinfield, eventueel met een koppeling naar je facturatietool.

• Lever je aan de overheid of grote bedrijven: Zorg dat je programma e-facturen via Peppol (UBL) ondersteunt.

Er bestaat geen 'beste' programma voor iedereen — er is alleen het programma dat het beste past bij jouw situatie. Twijfel je nog? Begin klein en gratis, en stap over zodra je merkt dat je meer nodig hebt. Zo betaal je nooit voor functies die je (nog) niet gebruikt.

Veelgestelde vragen

In welk programma kun je het beste een factuur maken?
Er is geen programma dat voor iedereen het beste is. Voor een startende ZZP'er volstaat een gratis online factuurtool, terwijl een webshop- of marktplaatsverkoper beter af is met een tool die automatisch factureert, zoals Winkel Factuur. Wil je boekhouding en facturatie combineren, dan past een boekhoudpakket als e-Boekhouden, SnelStart, Yuki of Exact Online beter.
Heb ik een boekhoudprogramma nodig om een factuur te maken?
Nee. Een boekhoudprogramma is handig als je je hele administratie wilt bijhouden, maar voor alleen facturen maken is het niet nodig. Een losse facturatietool of online factuurprogramma is vaak eenvoudiger en goedkoper als je uitsluitend wilt factureren.
Kan ik gratis een factuur maken in een programma?
Ja. Er zijn diverse gratis factuurprogramma's en online tools. Bij Winkel Factuur probeer je elk pakket 15 dagen gratis; Starter is daarna €9 per maand voor 100 facturen. Let bij gratis tools wel op beperkingen zoals het aantal facturen, ontbrekende automatisering of een logo van de aanbieder op je factuur.
Welk programma is het beste voor een webshop of marktplaats?
Voor webshops en marktplaatsen is automatisering het belangrijkst. Je wilt dat er automatisch een correcte factuur wordt gemaakt bij elke bestelling, met het juiste btw-tarief, en dat alles overzichtelijk samenkomt. Winkel Factuur is hier speciaal op gericht en koppelt met kanalen als bol.com, Amazon, Shopify en WooCommerce.
Moet mijn factuurprogramma e-facturen (Peppol/UBL) ondersteunen?
Dat hangt af van je klanten. Lever je aan de overheid, dan is e-facturatie via Peppol verplicht. Lever je aan grote bedrijven, dan vragen die er steeds vaker om. Voor particuliere klanten en kleine bedrijven is een nette pdf-factuur meestal voldoende, maar het is verstandig een programma te kiezen dat UBL en Peppol ondersteunt, zodat je klaar bent voor de toekomst.

Maak je facturen automatisch, ook vanuit je webshop

Winkel Factuur maakt automatisch correcte facturen voor elke bestelling uit je webshop of marktplaats. 15 dagen gratis proberen, geen creditcard nodig.